申请保密专利的主要步骤和注意事项如下：
申请人需确定其发明或实用新型专利申请是否涉及国家安全或重大利益需要保密。
申请人应在提出专利申请的同时，在请求书上提出保密请求。
申请人也可以在发明专利申请作好公布准备之前，或者实用新型专利申请作好授权公告准备之前，提出保密请求。
若申请人在提出保密请求前已确定其申请内容涉及国家安全或重大利益需要保密，应当提交有定密权限的机关、单位出具的保密证明材料。保密证明材料中应包括发明创造名称、申请人姓名或名称、密级、保密期限、保密原因及保密要点、定密责任人、定密机关或单位的联系人和联系电话、申请人机要通信地址以及定密日期，并加盖定密机关或单位的公章。
在提交专利申请之前，可以与专利申请机构签署保密协议，以确保申请过程中的信息不被泄露。
申请人需要确认需要保密的内容和期限，并选择合适的专利申请方式，例如通过邮寄或电子申请等方式进行提交。
保密专利申请需要经过专利局对专利内容和技术特征的审查，如果符合保密专利的要求，申请会被审批通过并获得保密专利权。
在获得保密专利权后，需要积极维护专利权，并及时更新专利细节信息，以确保专利权的有效保护。
若申请人希望申请国际专利，需要注意不公开请求的限制，因为提交不公开请求意味着放弃国际专利申请机会，并且可能无法成为现有技术的一部分以拒绝其他类似发明申请。
通过以上步骤和注意事项，可以有效保护申请人的发明或实用新型专利在申请过程中的保密性，避免关键信息泄露，确保申请的成功和专利权的有效维护。